MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p2BJAB07104

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021728	CAT	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021728	GCTG	2	8	102	109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021728	TC	3	6	315	320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021728	CGT	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021728	CAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021728	GAA	2	6	378	383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021728	TCA	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021728	CG	3	6	433	438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021728	TGCTC	2	10	441	450	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021728	AAC	2	6	505	510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021728	CCA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021728	T	7	7	1571	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021728	AGC	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021728	AGC	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021728	GCC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021728	ATTC	2	8	3017	3024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021728	CGC	2	6	3032	3037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021728	CGC	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021728	CGCGG	2	10	3896	3905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021728	TAT	2	6	3976	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021728	ATA	2	6	3994	3999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021728	AT	3	6	4020	4025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021728	GGCT	2	8	4033	4040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021728	CCG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021728	ATTTT	2	10	4155	4164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021728	ATCC	2	8	4182	4189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021728	CGT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021728	TGC	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021728	GCC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021728	GTT	2	6	5247	5252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021728	TG	3	6	5297	5302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021728	CGA	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021728	CCG	2	6	5377	5382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021728	TGG	2	6	5438	5443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021728	AAC	2	6	5496	5501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021728	GGA	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021728	TC	3	6	7218	7223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021728	TTA	2	6	7262	7267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021728	GAG	2	6	7351	7356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021728	GGT	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021728	CAA	2	6	8273	8278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021728	CTT	2	6	8394	8399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021728	GTT	2	6	8435	8440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021728	A	6	6	8498	8503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021728	AT	4	8	9410	9417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021728	TTA	3	9	9484	9492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021728	ACA	2	6	9574	9579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021728	ATGC	2	8	9638	9645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021728	TTC	2	6	9690	9695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021728	TCATT	2	10	9709	9718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021728	T	6	6	9717	9722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021728	T	6	6	9736	9741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021728	ACA	2	6	9792	9797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021728	CTGAT	2	10	10005	10014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021728	CTT	2	6	11270	11275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021728	ATTTT	2	10	11303	11312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021728	T	6	6	11309	11314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021728	TGG	2	6	11384	11389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021728	TGT	2	6	11395	11400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021728	AT	3	6	11411	11416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021728	AT	3	6	11421	11426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021728	AAAGTA	2	12	11427	11438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021728	T	9	9	11526	11534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021728	GGA	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021728	TGC	2	6	11581	11586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021728	A	6	6	11589	11594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021728	TAAA	2	8	11615	11622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021728	ATTA	2	8	13122	13129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021728	TTGG	2	8	14080	14087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021728	ATT	2	6	14258	14263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021728	TAA	2	6	14314	14319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021728	CAT	2	6	14321	14326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021728	T	6	6	14331	14336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021728	GAG	2	6	14337	14342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021728	ATT	2	6	14345	14350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021728	A	6	6	14380	14385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021728	CAGTA	2	10	16516	16525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021728	GCT	2	6	16541	16546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021728	TG	3	6	17040	17045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021728	GATT	2	8	17089	17096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021728	TC	3	6	17098	17103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021728	ATTG	2	8	17185	17192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021728	TTGA	2	8	17196	17203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021728	T	8	8	17214	17221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021728	AT	3	6	17307	17312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021728	T	6	6	17361	17366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021728	TTAAC	2	10	17409	17418	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021728	ATG	2	6	19042	19047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021728	GAT	2	6	19106	19111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021728	CAC	2	6	19120	19125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021728	AT	3	6	19153	19158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021728	CAT	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021728	TAGT	2	8	20028	20035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021728	GGT	2	6	20096	20101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021728	ATC	2	6	20111	20116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.